SMKN 3 Kotabumi memiliki tujuh pilihan kompetensi keahlian yang memberi ruang bagi siswa untuk mengembangkan minat, keterampilan, dan arah masa depan.
Pilihan tersebut meliputi Desain Komunikasi Visual, Teknik Komputer dan Jaringan, Teknik Pemesinan, Teknik Kendaraan Ringan Otomotif, Teknik Sepeda Motor, Desain Pemodelan dan Informasi Bangunan, serta Teknik Konstruksi dan Permodelan.
Setiap kompetensi dirancang untuk mendekatkan proses belajar dengan kebutuhan dunia kerja, kewirausahaan, dan perkembangan teknologi.